在特别篇中，描述了在2006年4月，阿久津真矢因在任教的小学期间所发生的数件事件的责任问题，而第2次被送往再教育中心，并从她每天到再教育中心的研修时，从她的回想中带出她过去所经历过的事情。除了神田和美（志田未来）与真锅由介（松川尚琉辉）外，没有其他旧有的6年3班学生的演出（从原来11集中转移过来使用的片段除外）。于2006年3月18日播放。讲述真矢在2002年11月至翌年2月，以中泉小学作为舞台，与一位横行霸道的男学生的对决。继续展示了真矢的过去，描述了在主故事中曾出现的“胸口上的大疤痕”背后的秘密，以及后来从2005年4月开始的近一年的时间到了半崎小学任教的原因，并在结尾时与主故事的第1集连接。

《女王的教室特别篇 后篇～恶魔降临～》是《女王的教室》第二季的特别篇，共分为前篇和后篇。本篇故事围绕着主人公桐野利秋展开，讲述了她持续为学生们带来疯狂的教育。

故事开始，桐野利秋（桐谷美玲 饰）重回学校，担任一年级3班的教师。利秋发现这一届学生并不是她想象中的平凡无奇，而是一群充满潜力的学生。于是，她决定在这个班级里实行一系列的压迫、虐待教育，让这些学生实现突飞猛进的成长。

在利秋的教育下，学生们的成绩得到了显著的提升，他们也变得更加奋发向上。但是，利秋的严苛教育却让学生们变得越来越疲惫，开始产生不满情绪。很快，班级里的一些学生联合起来，试图推翻利秋的独裁统治。

在学生们与利秋之间的冲突愈演愈烈中，一名丑陋的男子出现在学校里，他声称自己是“魔鬼的化身”——恶魔。在他的带领下，学生们陷入了无尽的黑暗中，面对利秋和恶魔的双重压迫，他们的内心充满了恐惧和无助。

在最后的决战中，利秋和学生们需要面对自己的内心，并且一次次尝试呼唤他们的勇气和信念。他们能否突破挣扎，在精神层面上战胜恶魔的邪恶力量，重获自由和梦想？这一切都将在这部恐怖悬疑的电视剧中揭晓。