神秘青年林昊身怀上古传承，精通中医药理之术，意外路过被小诊所聘为村医，凭借精妙的医术声名大震，许多富家显贵都慕名前来求医问诊。不过声名鹊起的同时，也引来各种觊觎与嫉妒的目光，危险也一步步向他靠近，且看少年，如何以医证道，力克强敌。

动漫《妙手神医》的男主角叫做路小雨，他长相不起眼，却是极其优秀的神医，被誉为“全球最顶尖的外科医生之一”。路小雨因为某些原因隐居了起来，但是，当他周围的人民遇到难题时，总是不忍心不出手相助，因此小雨也在逐渐成为乡亲们的翘首期盼的人。

在小雨的世界里，有许多人物是既人性复杂，又相当现实的。比如说，小雨的出场就是因为一个女孩子和一个男孩子的感情问题，但是最终小雨却帮助了这个两个人，却让自己险些被卷入了其中。小雨拯救了许多人的生命，却经常被无名小卒的无机会困扰到。

动漫中还有不少令人感动的故事，比如那个失去了记忆的女孩子，路小雨凭借自己的精湛医学技巧，找到了她的亲人，让她重获生命的希望，也有那个超重的中年男子，在路小雨的帮助下，最终重获了健康的身体。

由于小雨的帮助，他在乡亲们中间具有了相当的威望，并被人称为“妙手神医”。路小雨的家人和朋友的身体健康状况都相当水，但经常会有一些奇怪的事情发生，比如一个人的牙齿掉了，另一个人咳嗽了，等等。在这种时候，小雨就会使用自己的知识和技能进行救治。虽然这种情况常常很有趣，但它也会为整个动漫注入防止跌入平庸和无聊的气息。

动漫展现了医者顶尖的技能和知识，但也突显了各个人物的人性和所处的现实环境。全剧通过小雨的视角展现出许多人和事，无论是治疗一只生病的蝴蝶还是帮助乡亲走出困境，都彰显着小雨伟大的医者精神和慈悲心。