苏怡（胡杏儿饰）患先天性心脏病，身为机师的丈夫亦琛（吴镇宇饰）辞职后陪她到世界各地休养寻医，无奈病情逐渐加重，苏怡悄然离开了亦琛，她不愿心爱的人看见她死时的惨状。亦琛留在英国Manna（米雪饰）处已两年之久，弟弟亦风（吴卓羲饰）中间来过多次，他劝哥哥走出阴霾，投入新的生活。亦琛痛定思痛决定重返工作岗位。亦琛加入到天颂航空skyIette，除了原先几张熟面孔，新同事中还有一流机师顾夏阳（张智霖饰），由于见解相左，二人在工作中产生不少磨擦。夏晨（胡杏儿饰）是名飞机修械员，由于长相酷似苏怡，亦琛把她当妹妹看待。而亦风对夏晨颇有好感，这令兄弟二人之间出现芥蒂......

电视剧《冲上云霄II》是一部以航空为主题的剧情片，延续了前一部的故事线，讲述了关于航空业界的故事。

该剧主要围绕香港国际航空公司（CIA）的故事展开。故事开始于林嘉欣（郝洛摩饰）的母亲郑小姐（李水源饰）因为身体问题，无法再继续担任CIA副航空部经理而被迫辞职。面对巨大的压力，嘉欣选择了坚持和努力，决心在航空界展示自我。同时，重担也落到了她的爱人阮启文（方中信饰）身上，他被任命为CIA新的航空部经理。

在成为航空部经理的过程中，阮启文深感责任重大，力求改变公司的运营模式并提升员工的职业素养。他带领全体员工共同努力，推出了许多重大改革举措，包括提升服务质量、管理效率和安全标准等，使CIA公司逐渐走上了正确的发展道路。

同时，嘉欣也在不断成长和进步。她通过不断努力学习和参加培训，逐渐成为一名合格的航空员工。她积极面对工作中的困难和挑战，并展现出自己的专业能力和人际交往能力。

在故事中，阮启文的好友杨朗（邵美琪饰）也成为了CIA的一员。她拥有出色的技术和经验，成为一名优秀的飞行员。她与嘉欣成为了好友，并在工作和生活中相互支持和鼓励。

与此同时，剧中还描绘了香港航空界的各种纷争和挑战。包括与其他航空公司的竞争、与客户的合作、处理事故和应对困难等等。剧中还穿插了一些浪漫的爱情故事，展现了主要角色之间的感情纠葛和成长。

整部剧以航空为背景，通过讲述角色们在航空公司中的奋斗和成长，传达了责任、希望和坚持的主题。同时，该剧也展示了航空行业中的艰辛和美好，揭示了其中的背后故事和人性的光辉。

通过精彩的剧情和细腻的人物形象，电视剧《冲上云霄II》成功地展现了航空界的辉煌与挑战，引起了观众的共鸣和关注。