动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……

《百万吨级武藏》是一部以舰船为背景的历史战争类动漫作品，故事发生在二战期间的太平洋战场上。它以真实存在的战舰“武藏”为主角，讲述了它参与战争、完成任务，最终沉没于深海的传奇故事。

剧情背景设定在二战期间，日本航空母舰在波尔港遭到突袭，武藏成为唯一生还的战舰。剧中的武藏号是真实存在的战舰，它的庞大体量和强大火力成为它在战争中无与伦比的存在。但与此同时，它的巨大吨位也成为了它的弱点，使它成为敌人火力的优先目标。

动画以日本帝国海军的远征舰队作为主线，展现了舰船与舰船之间的战斗，以及日本舰队面临的诸多挑战与困境。武藏作为远征舰队的旗舰承担着重要的任务，它不仅要保护其他舰船的安全，还要消灭敌军的舰船，完成各项战略目标。而动漫中的武藏号不仅是一个冷冽的军舰，更是一个充满人性和勇气的战士。

剧情展现了战士们在航母上的高强度训练，共同应对敌人的袭击。在经历了一次次的战斗洗礼后，武藏的船员们不仅变得更加勇敢，还建立了深厚的战友情感，他们宛如一个大家庭。每当面对危机，船员们总能心有灵犀地协同作战，用智慧和勇气克服一切困难。

在战争中，武藏号展现出了顽强的生命力和强大的战斗能力。它同时也经历了无数次的战伤，船员们的勇气和奉献精神让它从一次次的战斗中拔地而起，坚定地继续奋战。然而，最终武藏号还是无法逃脱命运的安排，它在一次战斗中受到重伤沉没于深海，它的壮丽战斗也成为了历史上的传奇。

《百万吨级武藏》通过对历史上真实的战舰的再创作，展现了战争中的人性、勇气和奉献精神。它不仅是一部让人热血沸腾的战斗动漫，更是一部让人深思的作品。它回顾了历史，向那些在战争中牺牲和奋斗的人们致敬，同时也呼吁和平与理性。这部动漫以其精彩的剧情和细腻的描写，吸引了众多观众的目光并赢得了广泛的好评。