原黑帮老大的女儿胡家琳因遭二当家韩朗袭击而入院，原警察先身为胜联一员的韦峻轩一直守护在家琳旁，照顾家琳并苦苦向家琳道歉，家琳出院后，终于接受峻轩，两人结婚。韩朗扶持峻轩上位成为胜联老大，但仍背后控制峻轩。峻轩刚刚上位就遭到暗杀，韩朗留峻轩看管胜联，自己只身前往泰国欲打通中港所有运毒路线，却在泰国遭到仇家伏击被抓，不料在囚室竟遇到了被抓到泰国的子弹，子弹欲杀韩朗，却因正义感而下不了手。两人被关押而一筹莫展之际，被一神秘人救出，这神秘人竟是子弹女友陈玥琪！原来之前子弹和玥琪陷入危机，要被处决时，洛威并未杀死玥琪，而是把玥琪藏了起来，等机会让子弹和玥琪团聚，玥琪得知子弹被劫至泰国，不顾一切前来救援。子弹决心麻痹韩朗，提出和韩朗和解，两人协力重整了泰国黑道势力，返回香港。

电视剧《无间道》第三季以香港黑帮为背景，围绕着两个主要角色展开，讲述了黑帮世界的复杂关系和残酷斗争的故事。

第三季的故事主要围绕着两位对立的黑帮头目展开，其中一个是警方卧底林峰，另一个是李家鼎集团的继承人陈浩南。林峰一方面要在黑帮中保持地位，同时还要不惜一切代价将黑帮分子绳之以法；而陈浩南则面临着黑帮内部的权力斗争和家族的巨大压力。

故事开始时，林峰在警署被高级警官委派成为警方卧底，在李家鼎集团中担任保安部门的负责人。他与陈浩南的初次见面并不愉快，陈浩南对其高压态度和不信任感。随着时间的推移，林峰逐渐获得了陈浩南的信任，而陈浩南也被林峰的聪明才智所吸引。

在黑帮内部，陈浩南的父亲突然病倒，黑帮内部的权力之争愈演愈烈。一方面，陈浩南面临着家族的巨大压力，要继续守住自己的地位；另一方面，林峰也在警方卧底的身份下，努力搜集证据瓦解李家鼎集团。两人在黑帮的内部斗争中联手合作，但又存在暗藏心机的猜疑。

在剧情的高潮部分，林峰逐渐接近黑帮内部的高层，他成功地获得了一批有力证据，证明了李家鼎集团的非法活动。而陈浩南也终于战胜黑帮内部的权力斗争，成为了李家鼎集团的继承人。两人一度达到了合作的高潮，但他们的合作却不可避免地走向了分道扬镳。

最终，林峰决定将所有的证据交给警方，包括陈浩南的违法行为。在最后的一场决斗中，林峰和陈浩南两人展开了激烈的对决，两人不仅身受重伤，而且彼此之间也心生恶意。最终，林峰将黑帮的证据交给了警方，陈浩南被迫逃亡。故事以两人在海边相遇并长时间注视对方结束。

《无间道》第三季贯穿了黑帮的残酷斗争和人性的复杂关系，展现了黑暗世界中人们的勇气和智慧，同时也诠释了一个人在黑帮和正义之间的抉择与内心挣扎。剧情跌宕起伏，令人过瘾，给观众留下了深刻的印象。