王牌律师何正钰在经历事业滑铁卢后，搬进一间老旧公寓。在某种神秘力量下，与来自四个月前时空的热血女记者陈嘉岚相遇，并被迫成为了“室友”。两人因每晚46分钟的时空融合，开始了一段穿越时空的爱恋......该剧为《1006的房客》的大陆版。

《我的秘密室友》是一部青春爱情题材的电视剧，剧情主要讲述了校花向白马王子示爱却被拒后，意外与一位神秘室友产生了感情，并慢慢地发现了对方背后的故事的故事。

该剧的主人公是大学生乔重远和郑启明。重远是学校里的白马王子，学习优秀，体育和艺术都拿过奖。启明是个神秘的人，除了谈论卫生他不会与别人交流。重远曾发现过启明的一些不寻常的行为，但并没有引起太多的注意。

一天，重远父亲因为工作需要拜托重远暂时让印刷厂的女儿沈秋薇在他的房间住宿。重远对此毫不在意，甚至与沈秋薇签下了一个“室友协议”。然而，他却无意间揭开了启明身上的神秘面纱。启明原来患有轻微的自闭症，无法和别人交流，但他却对重远表现出了一种别样的关注，表现得很是突兀和难以理解。

在与启明的相处中，重远逐渐发现自己的心被启明所吸引，而启明对他也有着相同的感觉。两人经历了很多的波折和矛盾，但他们终于走到了一起，这场爱情也默默地照亮了启明内心深处的那份渴望。

虽然该剧描述了一段特殊的爱情，但同时也描绘了自闭症患者的内心。通过这部电视剧，观众将会进一步了解到自闭症的相关知识，让大家更深刻地认识到这一群体的特殊性和其所需要的包容与理解。